日本是一个资源贫乏的岛国，其海运对于日本来说就像生命线一样重要。而现在，在生化危机爆发后，这是又一次的大封锁行动，而且比二战中更为严密。现在的美国已经顾不上应对中国的亚洲扩张带来的威胁了，美国海军派遣了第七舰队的全部和第三舰队的一部在日本周边严密布防，防止任何人离开日本，亚洲各国海军一面严查自己的海岸线安全，一面派出舰队配合美军，甚至是日本自己的海自，也都参加了对日本的封锁行动。所有的港口都有美军进驻，严密监视，禁止任何船只离开。
空中交通也被封锁，所有的民用机场都被美军控制，只有经过美军批准的外交专用飞机和美军自己的军用飞机才可以起飞和降落。
日本政府已经紧急转移到自己海自的两栖攻击舰“出云”号上进行遥控操纵。而日本那些有名的科学家和学者教授也被美国政府进行“优先”T病毒测试后带往美国“暂时居住”。甚至连很多博物馆的国宝和藏品也都被以“保护”的名义由美军部队负责装箱，运往美国各博物馆“展览”。现在的日本已经从美国的“间接管理”变成了“直接管理”，日本政府最后的一丝遮羞布被美国人彻底撕下，然而此时的日本人，连屈辱都已经无法感受到。
整个日本已经被彻底封锁。同时由于T病毒的排查工作十分耗时耗力，加上除了大城市外，其他地区的控制力很低，美国政府针对这种全岛的封锁制定了一年的计划，以确保岛上的病毒不会再次爆发。
如果说美军一开始的行动非常成功，有效的阻止了病毒的爆发，赢得了日本人的一致好评的话。那么就和伊拉克战争一样，后来的长期控制就逐渐形成了一场不折不扣的灾难。
由于被封锁，日本列岛上1.25亿日本人的各种供应就都要靠自己的储备和美军开始提供。最初的供应还比较充足，但是随着日本政府的迁移，对国内的控制力开始下降，补给发放等各种环节就开始有怠工，腐败等等事件频发。而美国的供应由于政府耗资巨大，转而外包给各路承包商来进行，这些承包商受到利益驱使，也逐渐开始缺斤短两和腐败丛生，一场人道主义灾难已经呼之欲出。
日本东京湾美军控制东京一周后
昔日繁忙的东京湾此刻已经异常萧条，无论是货轮还是客轮都被封锁在港内禁止出入，海面上漂泊着美国海军第七舰队的4条驱逐舰和十几条快艇，在东京湾执行封锁任务，没人敢挑战美军的看守是否敢开火。
紧挨着东京湾的东京区依然笼罩在一片恐慌中——即使已经封锁了1周，但是美军却依然在东京那号称“东京地下迷宫”的地铁中击毙了数名已经病发的感染者，估计是躲藏在这里的流浪汉或者非法移民。这让这场封锁依然必须继续进行下去。每家每户得到的物资也开始减少，人们的感觉也由最初欣喜的获救变成现在对前景的渺茫。
东京是国际化大都市，在这里工作和生活以及旅游的各国人不计其数，现在，他们也都被困在了这里，禁止外出，禁止回家，就连美国人也不例外——美国政府也不感冒着自己被感染的危险把人带回去。
大批各国的游客和侨民被困在此地。理论上，他们只有在接受完T病毒检查后，才被允许返回各国大使馆，再由大使馆安排专机回国。然而T病毒检测昂贵的费用和消耗的时间决定了大多数人都只能在原地等待，除了那些有钱和有权的人能够通过各种关系和手段排队加塞提前检查后乘坐外交包机提前离开之外。剩下的人即使是他们自己的国家都不希望他们回来，避免将生化病毒从日本带回本国。让在这里的每一个外国人顿时都有了一种被抛弃的感觉。
当然，一个国家除外。
这一天的东京湾，除了继续飘扬在这里表明这还不是美国正式领土的太阳旗和军舰上的星条旗外，又多了另外一种颜色——红色。鲜艳的五星红旗也在东京湾上空飘扬，覆盖了东京的街头。
以一条综合补给舰，一条医疗船和两艘驱逐舰组成的中国海军第一批撤侨编队突破美国海军的封锁，驶入了东京湾，停泊在港口。中国海军陆战队员们立即下船，建立检查站，准备迎接登船。
东京市内，除了依然在四处站岗的美军和日本陆自外，又多了一只身穿数码迷彩的中国武警部队，荷枪实弹的护送着拖家带口扶老携幼的中国侨民撤离。这些侨民有条不紊的排着队，每人手上都拿上了一面小国旗，一边挥舞一边跟在领头的武警战士挥舞的较大的五星红旗之后前进，脸上布满了幸福和感激的笑容。一些身穿西服的干部模样的人沿途站在高处，拿着大喇叭指挥，防止有人掉队，一边号召大家帮助那些老年人和妇孺，一边高声喊道：
“同胞们，跟着五星红旗走，祖国是不会抛弃你们的！”
听到这样的声音，所有人的内心都是暖洋洋的，许多人都流下了激动的眼泪。
这些队伍也各有特色，他们中有留学生，务工人员，游客，侨胞等每一种身份的人都分别组成了自己的队伍，整齐有序的跟着各自的领队，排着整齐的队伍前进，给11月的东京带来一道特有的风景线。
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